تعیین نواحی اپی توپی سلول b و t پروتئین فلاژلین از باکتری کلستریدیوم شووای، عامل بیماری شاربن علامتی در دام با استفاده از تجزیه و تحلیل های بیوانفورماتیکی

سابقه و هدف: شاربن علامتی از جمله بیماری های حاد و موثر بر گاو و گوسفندان جوان است که علائم این بیماری ایجاد میوزیت و مسمومیت است که اغلب کشنده می باشد. عامل این بیماری باکتری کلستریدیوم شووای است که یک باکتری گرم مثبت، میله ای شکل و بی هوازی است و تولید گاز و اسپور می نماید. اسپور این باکتری مقاومت بالایی دارد و می تواند در خاک و غذا سال ها زنده بماند. ابعاد این باکتری 8-3×1-5/0 میکرون است و معمولاً به صورت انفرادی، گاهی دیپلو، بندرت استرپتو باسیل مشاهده می گردد. مهمترین آنتی ژن حفاظتی این باکتری فلاژلین نامیده می شود که یک پروتئین سطحی است و در پروتئین فلاژلا قرار دارد. ازآنجا که پروتئین فلاژلین یک فاکتور بیماری زایی است، بنابراین یک آنتی ژن حفاظتی به شمار می آید که در سال های اخیر بسیار مورد توجه قرار گرفته است و از آن می توان در طراحی واکسن نوترکیب استفاده کرد. هدف اصلی از مطالعه ی حاضر بررسی پروتئین فلاژلین با استفاده از تجزیه و تحلیل های بیوانفورماتیکی و مشخص کردن نواحی اپی توپی مربوط به سلول b و t است. مواد و روش ها: با استفاده از نرم افزار های بیوانفورماتیکی پیش بینی کننده ی اپی توپ های سلول b و t و همچنین نرم افزارهای پیش بینی کننده ی ساختار دوم و سوم پروتئین، اپی توپ های نهایی پروتئین فلاژلین بر اساس بالاترین امتیاز و بیشترین تکرار در نرم افزارها تعیین شدند و در نهایت به منظور بررسی بیشتر خواص اپی توپ های انتخاب شده، بررسی هضم آنزیمی و توان آنتی ژنی اپی توپ های نهایی با نرم افزار vaxijen 2.0 با حد آستانه 8/0 نیز به کمک نرم افزار های تحت وب مربوطه انجام شد. یافته ها: نتایج بدست آمده در مطالعه حاضر سه اپی توپ در دامنه ی توالی آمینواسیدی 95-107، 311-320، 399-406 برای سلول t و 3 اپی توپ با توالی اسیدآمینه ای 146-156، 246-254، 291- 299 برای سلول b مشخص کرد و نشان داد که توالی آمینو اسیدی 32_ 45 یک اپی توپ مشترک برای سلول ها b و t است. در نهایت تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی ساختار دوم و سوم نشان داد که توالی اسید آمینه ای 32_45 ناحیه ی اپی توپی مشترک در دو گروه سلول های b و t می باشد که 61 درصد این ناحیه شامل حلقه های تصادفی است و در سطح ساختار آنتی ژن فلاژلین قرار دارند. نتیجه گیری: استفاده از توالی اسید آمینه ای اپی توپ های حاصله بخصوص اپی توپ مشترک در سازه های نوترکیب مورد استفاده در واکسن های نسل جدید می تواند علاوه بر حذف خطرات ناشی از آثار سوء واکسن های زنده و تخفیف حدت یافته، سطح بالایی از پاسخ سیستم ایمنی را در بدن میزبان آلوده به باکتری کلستریدیوم شووای به وجود آورد.